Восстановление не удалось: «Некоторые загрузки не удалось перенести на новую схему»

Вы пробовали отключать загрузку в S3 перед созданием резервной копии?
Просто отключение S3 без повторной загрузки не должно нанести никакого вреда. Затем восстановите и снова включите S3.