Я имел в виду: пока я создал новую машину Vagrant, без копирования каких-либо предыдущих резервных копий. Выполнил запуск и запуск контейнера Docker. Сделал резервную копию.
Внутри машины Vagrant ничего не видно за пределами машины Docker.
Кажется, я нашел проблему: я подключил эту общую папку Docker в машине Vagrant.
config.vm.synced_folder "discourse/", "/var/discourse"
Если закомментировать это в моем файле Vagrantfile, резервные копии «волшебным образом» появляются.
Так что проблема заключалась в том, что общая папка Vagrant (для «вверх») и общая папка Docker (для «вниз») конфликтуют и делают её недействительной.