Você pode tentar ativar a configuração do site “suporte a direção de texto mista”. Confira Supporting mixed text directions para detalhes sobre a configuração.
Quando ativada, a configuração adiciona um botão Alternar Direção ao compositor:
Não testei isso com o plugin MathJax, mas deve facilitar bastante a escrita de equações longas. Se você testar a configuração e encontrar algum problema, por favor, nos avise.