Нет, мы запускали собственную среду, и я нашел виновника.
Мы выполняли несколько задач rake в одной команде (RAILS_ENV=production bundle exec rake db:seed_fu multisite:migrate multisite:seed_fu).
db:seed_fu был нужен для обхода бага, существовавшего уже 10 лет. Когда я запускаю его отдельно, проблема исчезает. И благодаря вашему комментарию выше я теперь понимаю, что происходило.