Cuando desactivas manualmente a un usuario, no se le envía automáticamente un correo electrónico pidiéndole que revalide, aunque puedes presionar el botón que aparece en su página de usuario/administrador para reenviarlo.
Cuando una cuenta inactiva intenta iniciar sesión, se le debería presentar una pantalla como esta, donde puede elegir que se le envíe una nueva:
No estoy seguro de por qué tu captura de pantalla parece carecer de esa opción. 
¿Podría ser algún código personalizado que hayas agregado para ocultar un botón en particular que también ha ocultado accidentalmente este? ¿Aparece en modo seguro?
Editar: Después de investigar un poco, creo que es la configuración de must approve users (los usuarios deben aprobar) lo que hace que el cuadro desaparezca. Cuando la habilito, ya no obtengo la opción que aparece:
No estoy 100% seguro de que sea intencional.