Se hai spazio su disco e un docker aggiornato, probabilmente andrà tutto bene.
Se hai un sistema operativo obsoleto, che ti porta ad avere un docker vecchio, dovresti avviare una nuova VM e spostarti su di essa come descritto in Spostare un sito Discourse su un altro VPS con rsync.
Sono abbastanza sicuro che almeno la maggior parte delle persone che hanno avuto problemi abbiano versioni Docker obsolete, la maggior parte delle quali sono causate da versioni obsolete del sistema operativo.
Se avvii una nuova VM, nulla potrà andare storto poiché il tuo vecchio server sarà ancora disponibile.