O mecanismo extraHrefMatchers em pretty-text.js.es6 não parece permitir strings de consulta ou esquemas sem ://…
Enquanto isso, você pode colar os links em um bloco de código para que as pessoas possam copiá-los, por exemplo:
magnet:?xt=urn:btih:e2467cbf021192c241367b892230dc1e05c0580e&dn=ubuntu-19.10-desktop-amd64.iso&tr=https%3A%2F%2Ftorrent.ubuntu.com%2Fannounce&tr=https%3A%2F%2Fipv6.torrent.ubuntu.com%2Fannounce
Vamos talvez revisar isso depois que o IE for descontinuado.