Não se preocupe. Kris ou outra pessoa eventualmente atualizará o tema.
Se você estiver curioso do lado técnico, isso está relacionado a Removing support for "template overrides" and mobile-specific templates.
Se forem apenas alterações de CSS, eu encorajaria você a criar um novo componente de tema:
Em seguida, anexe-o ao tema Reddit-ish oficial e mova seu CSS para este componente.
Dessa forma, você recebe atualizações oficiais enquanto mantém seu CSS personalizado.