Да, хранение загрузок осуществляется по замыслу. Если резервная копия была сделана с односайтового экземпляра, она восстанавливается иначе.
was_multisite = BackupMetadata.value_for("multisite") == "t"
upload_path = "/#{Discourse.store.upload_path}/"
uploads_folder = was_multisite ? "/" : upload_path
Но речь ведь шла о том, куда помещаются резервные копии, а не о том, куда восстанавливаются изображения?