これに気づきました：Configure VERP to handle bouncing e-mails - #166
これは bounce_score_threshold_deactivate 設定の削除に関するものです。これが誤りだったのではないかと思い始めます。デフォルト設定が達成しにくかったなら、その値を下げるべきだったはずです。
大規模なフォーラムにとって、その削除が招く意図しない結果の一例は、長年にわたり無効なアドレスへのメール送信が徐々に増加することです。それにより、外部サービス（Mailgun のように、1 回のpermanent failバウンスでアドレスを抑制するサービスなど）とのトラブルや、IP レピュテーションの低下につながる可能性があります。
現状では、私の理解が間違っていなければ、Discourse は送信できていると認識しているメールが、Mailgun の抑制リストにより拒否されているだけという状態です。Discourse のアプローチと Mailgun のアプローチを同期させることはできません。