Sono riuscito a impostare la versione su 2.9.0.beta2 (id commit: 88a8584348ed93a28286839bfc1c32b06bd50b3f) impostando l’id commit come “version” in app.yml. Questa volta l’aggiornamento ha funzionato. Dopo di che sono stato in grado di aggiornare a 3.0.0.beta16.
Grazie a tutti.