Eu tentei, mas parece que um endpoint de API para excluir um upload não existe.

Estou postando isso aqui, pois não consegui encontrar menções ou sugestões sobre isso, o mais próximo que encontrei foi: API: a scope with access to /uploads
Nas configurações de escopo granular da chave de API para uploads, vejo que ‘create’ (criar) está disponível, mas ‘delete’ (excluir) não está.
Parece que uma possível solução alternativa poderia ser criar uma automação personalizada e acioná-la via API.