Спасибо, @sam! Я получил два личных сообщения (одно от @JammyDodger), и мои настройки не были переопределены. Я так и не смог докопаться до сути этой загадки 
Не уверен, имеет ли это значение, но в нашем экземпляре Discourse эти личные сообщения отправлены от тестовых пользователей. Они публикуются через электронную почту, но, насколько я знаю, это не должно иметь значения.
Есть ли в Discourse настройка для переопределения предпочтений по электронной почте? Возможно, я случайно её включил. На данный момент это единственное логичное объяснение 