Quisiera preguntar para qué sirve este archivo /var/www/discourse/vendor/data/RT_sRGB.icm?

Es posible que sea más fácil de gestionar si creas enlaces simbólicos a los archivos GeoIP en /var/www/discourse/vendor/data hacia un montaje separado que contenga los archivos GeoIP del host, así no tendrás que preocuparte por nada más en ese directorio.