Ваша таблица уведомлений всё ещё огромна. Сравните, например, метрики:
notifications | 1230140 | 316 MB | 581 MB | 897 MB
Попробуйте следующее (первая команда может временно вызвать ошибки или перевести базу в режим только для чтения во время выполнения):
VACUUM FULL VERBOSE notifications
и
REINDEX DATABASE «yourdatabasename»
После этого, пожалуйста, снова опубликуйте статистику.
(Судя по другим таблицам, ваша таблица posts также имеет огромные индексы — в meta у нас 3933 MB при индексах всего 674 MB. Если вы сможете выделить короткое окно простоя, я рекомендую выполнить VACUUM FULL VERBOSE, что оптимизирует всю базу данных, а затем выполнить перестроение индексов.)