Honestamente, no sé qué pudo haber causado que esos temas no tuvieran sus registros de topic_embed.
Pero si miramos el panorama general, ¿no tendría más sentido seguir la configuración que sugerí antes? Si agregamos una casilla de verificación directamente en la configuración de la categoría para aplicar noindex a todos los temas dentro de ella, no tendríamos que depender de la función de incrustación ni preocuparnos por si esos registros existen desde el principio.