No hay ninguna opción para deshabilitar directamente ese comportamiento. Creo que está controlado por la configuración del sitio enable_markdown_linkify, así que podrías desactivarlo, pero en ese caso también se desactivaría el enlace automático de URLs en texto plano en todas partes, no solo en los correos electrónicos…
La solución con comillas invertidas (backticks) es la forma más fácil, a menos que quieras crear un plugin para anular el comportamiento de markdown.