Entiendo lo que quieres decir. Hice un pequeño screencast para demostrarlo.
Lo mismo ocurre en mi sitio (y aquí en meta), incluso con el selector en la barra lateral. Resulta ser un poco menos feo porque los colores están más cerca y el botón no es tan prominente en la cabecera como en tu caso.
Probablemente sea una corrección de diseño bastante menor para evitarlo y estoy de acuerdo en que es una buena idea.