Обратитесь к провайдеру VPS по поводу увеличения объёма оперативной памяти. При достаточном количестве RAM использование swap-раздела не требуется.
Вы можете рассмотреть использование утилиты мониторинга сервисов, такой как monit, для автоматического перезапуска вашего контейнера при сбое процессов. Однако проблема будет усугубляться по мере роста числа активных пользователей, и со временем существует риск повреждения базы данных.