Sim, eu pessoalmente usaria essa opção. Provavelmente ocultaria os Tópicos sugeridos, mantendo os Tópicos relacionados ativados.
Os Tópicos sugeridos muitas vezes parecem menos relevantes para mim, pois podem introduzir discussões não relacionadas, enquanto os Tópicos relacionados geralmente são mais úteis quando quero continuar lendo sobre o mesmo assunto ou encontrar discussões semelhantes.
Não acho que eu faria a mesma escolha em todos os sites Discourse. Dependeria de como a comunidade está estruturada e de quão úteis são as recomendações. Em um fórum grande com muitas categorias e muita atividade, eu provavelmente ocultaria os Tópicos sugeridos. Em uma comunidade menor ou mais focada, onde as recomendações costumam ser precisas, eu talvez mantivesse ambos ativados.
Ter preferências separadas seria melhor, pois diferentes usuários têm hábitos de navegação distintos, e isso permite que todos personalizem a experiência sem afetar a configuração padrão do site.