Добро пожаловать, Даниэль! 
Я не знаком с Pendo, но если это просто фрагмент JavaScript, который нужно добавить, вы сможете сделать это через панель администратора вашего Discourse:
Настройка → Темы (или Компоненты — возможно, будет удобнее создать новую, если на вашем форуме несколько тем) → Редактировать CSS/HTML → вкладка Head.
Дайте знать, если Pondo требует чего-то ещё 