Consegui reproduzir isso no meu site de teste local. Não tenho certeza se esse é o comportamento esperado ou não, mas vejo como isso pode causar problemas. Acredito que remover uma categoria da lista de categorias silenciadas de um grupo deveria, automaticamente, desativar o silenciamento da categoria para os usuários desse grupo, ou oferecer ao administrador a opção de desativar o silenciamento da categoria para esses usuários.