Верно, Cloudflare не может ничего сделать для снижения нагрузки на сервер приложений. Как одностраничное JavaScript-приложение, Discourse действительно не получает от этого пользы.
Более того, размещение Discourse за Cloudflare добавляет дополнительные сетевые переходы для каждого запроса между приложением в браузере и сервером, что приводит к незначительному увеличению времени отклика.
Вы храните загрузки на сервере или используете S3 или аналогичную альтернативу?