Первая строка — fatal: not a git repository (or any parent up to mount point /), что означает, что вы каким-то образом повредили репозиторий Git в папке /var/discourse, когда пользователь следовал официальному руководству по установке.
Вам нужно это исправить. То, как он повреждён, означает, что у вас отсутствуют обновления, и поэтому отсутствуют элементы, которые должны там быть, из-за чего всё ломается.