Sí, creo que es principalmente el uso de negritas lo que está causando la distorsión.
O desactiva todas las fuentes en negrita con una anulación global, o asegúrate de que la fuente que estás utilizando tenga una variante específica en negrita.
Leí que esta podría funcionar mejor: Jameel Noori Nastaleeq Kasheeda: Download for free at Urdu Fonts : Urdu Fonts