Я только что протестировал это с включённой опцией «Категория дублирует рассылку» для категорий A и B, и теперь мне удалось воспроизвести проблему. 
- Настройте категории A и B, присвоив им адреса для входящей почты (categorya@[MyTestSite] и categoryb@[MyTestSite]).
- Включите для каждой категории опцию «Категория дублирует рассылку».
- Установите для test_user статус «Слежение» для обеих категорий.
- Установите значение «Временное окно для писем (мин)» на 1 минуту (необязательно, но ускоряет процесс).
- Администратор создаёт тему в категории A.
- Пользователь test_user получает уведомительное письмо о новой теме в категории A и пересылает его с сообщением в категорию B.
- Пересылка отображается как ответ на исходную тему в категории A.
Я не очень хорошо разбираюсь в рассылках: это ошибка или конфликт настроек?
И похоже ли это на то, что могло бы помочь и в вашей проблеме, @dachary?