La soluzione «ovvia» per me sarebbe mostrare nella pagina principale delle preferenze qualcosa come gruppi di categorie per le impostazioni, ad esempio come schede con icone o come elenco.
In aggiunta a ciò: una barra di breadcrumb navigation in alto per mostrare sempre la propria posizione e fornire un modo semplice per tornare indietro, sia su mobile che su desktop.