Если ваша конфигурация S3 находится в файле app.yml, вы можете просто выполнить восстановление через командную строку, и оно загрузит резервную копию из S3.
Так как ваши файлы хранятся в S3, резервная копия содержит только базу данных.
Вам достаточно клонировать новую директорию /var/discourse, скопировать туда ваш файл yml, выполнить пересборку и запустить восстановление через командную строку.
Использование объектного хранилища для загрузки файлов (S3 и клонирование)