Спасибо за быстрый ответ, @JammyDodger! Я только что проверил: мы используем только одну тему (думаю, URL — /admin/customize/themes):
Возможно, я ошибаюсь, но думаю, что Custom Header Links не имеет отношения к этой проблеме. Кроме того, на данный момент установлена последняя версия.