No estoy seguro si esto cuenta como una característica o un error — creo que podría ser un “defecto” en el sentido técnico. O tal vez simplemente no entiendo algo. 
Los sinónimos de etiquetas son una característica útil para mantener un sitio organizado. Pero, en este momento, si creas uno, la etiqueta permanece pero se muestra como si no tuviera temas asociados. Esto significa que permanece en la página de etiquetas y aparece cuando la gente busca. El último comportamiento podría ser deseable en algunos casos (por ejemplo, si tienes un montón de términos específicos mapeados a una etiqueta más general), pero en otros casos (la gente sigue creando una etiqueta de error tipográfico, ¡estás cansado de limpiarla!) definitivamente no lo es (solo debería aparecer si se vuelve a usar ese error tipográfico exacto).
En segundo lugar, si se presiona el botón “Eliminar etiquetas no utilizadas”, todos los sinónimos son destruidos. Eso no puede estar bien, ¿verdad?
¿Quizás un enfoque sería agregar automáticamente estos a un grupo de etiquetas “sinónimos de etiquetas” y luego manejar ese grupo de manera especial?