Il modo più semplice al momento è installare lo stesso tema due volte e modificare la palette (e anche il nome del tema, così sai quale è quale).
È più semplice se il tema è remoto (su git) perché in tal caso tutti gli aggiornamenti sono gestiti centralmente. Se il tema è stato creato localmente nell’interfaccia di amministrazione, puoi esportarlo e reimportarlo. Il metodo del tema locale è un po’ più scomodo perché devi modificare entrambi i temi se vuoi apportare delle modifiche.