Привет, @bekircem,
Кажется, переустановка могла бы решить проблему с тем, что cloudflared не находит сертификат…
Что касается запуска Cloudflare как службы: файл конфигурации, который вы создали при ручном запуске службы, нужно переместить в каталог /etc/cloudflared.
Я не уверен насчёт ссылок на личные сайты здесь, поэтому дайте знать, если мне нужно будет их удалить. Однако я уже освещал эту тему в одном из своих блогов в разделе под названием: ‘Настройка и запуск Cloudflared как службы’
Дайте знать, как у вас получится!
Алекс.