Какую версию вы используете? Вы храните загруженные файлы в S3 или локально?
Скорее всего, задача очистки удалила множество загруженных файлов. Предлагаю извлечь файлы за 2019-07-03 и 2019-07-06 и создать разницу. Отсутствует ли что-то, чего не должно быть?