Let's Encrypt с несколькими доменами не работал для ECC-сертификатов

Я ещё этого не сделал. Я ждал, чтобы убедиться, что вы считаете, будто это работает.

Вот изменение: просто добавлено global: true в конец второго replace:

    - replace:
        filename: "/etc/runit/1.d/letsencrypt"
        from: /--fullchainpath/
        to: "-d =domain2=  --fullchainpath"
        global: true

А вот полный вариант:

  after_ssl:
   # сообщить letsencrypt, какие дополнительные сертификаты нужно получить
    - replace:
        filename: "/etc/runit/1.d/letsencrypt"
        from: /--keylength/
        to: "-d extrahostname.myforum.us --keylength"
    - replace:
        filename: "/etc/runit/1.d/letsencrypt"
        from: /--fullchainpath/
        to: "-d extrahostname.myforum.us  --fullchainpath"
        global: true