Будьте осторожны и не думайте, что веб-интерфейс для обновлений всегда будет работать. Обновление через веб-страницу не всегда возможно. Некоторые обновления (например, очень свежее обновление версии базы данных) потребуют пересборки из командной строки. Это означает, что вам нужно будет получить доступ к серверу через SSH и использовать командную строку для пересборки.
В отличие от многих администраторов, я обычно использую веб-интерфейс для обновлений, но при этом держу открытую консоль, чтобы при необходимости выполнить обновление вручную.