Dipende da cosa desideri cambiare. Se vuoi rimuovere o ridisegnare alcuni contenuti, probabilmente puoi farlo aggiungendo del CSS. Se invece desideri aggiungere informazioni o modificare drasticamente il layout, dovrai modificare i file dei template.
Nel tema Minima, ho modificato il template dell’elenco dei argomenti per riposizionare o rimuovere alcune avatar. Puoi vederlo qui: https://github.com/discourse/minima/blob/master/desktop/header.html
Se desideri utilizzare il tema Minima e aggiungere personalizzazioni ulteriori, ti consiglio di installare Minima e aggiungere le tue modifiche creando un nuovo componente del tema. In questo modo potrai continuare a ricevere gli aggiornamenti di Minima senza preoccuparti che le tue modifiche vengano sovrascritte.