Я только что проверил свой тестовый сайт, и, по моему мнению, значение по умолчанию для уведомлений по электронной почте в чате — «только когда я отсутствую» (альтернативный вариант — «никогда»).
Я думаю, что есть смысл добавить возможность устанавливать значение по умолчанию в настройках администратора для предпочтений пользователя, хотя, вероятно, в обратном порядке от того, что вы предлагаете. 
Это будет работать так же, как и другие значения по умолчанию: оно изменит предпочтение только для тех пользователей, которые ещё не выбрали его вручную.
Я перенёс это в раздел Contribute > UX для рассмотрения. 