Похоже, вы исправили это самостоятельно! Хорошо это знать.
Для всех остальных, кто это читает: вскоре после версии v2.6.0.beta1 была обнаружена ошибка. Я исправил её в FIX: Backups should use relative paths for local uploads · discourse/discourse@f51ccea · GitHub и перенёс исправление в бета-ветку.
Отныне резервные копии будут создаваться корректно, а восстановление резервной копии, созданной в период между v2.6.0.beta1 и внесением исправления, также будет работать без проблем.