Предотвратить это во время обновления?

Извините, это непрошеный совет и он не отвечает на ваш вопрос… Я бы предложил обновляться реже — так у вас будет меньше неизбежного простоя, и вы с меньшей вероятностью обновитесь в момент, когда что-то работает со сбоями. Лично я обновляюсь, когда выходят релизы, но также жду день или два, чтобы дать возможность исправить возможные неполадки.