Нет.
Смотрите Конфигурация нескольких сайтов с Docker и Конфигурация нескольких сайтов с Let’s Encrypt и без обратного прокси.
Вы также можете запустить несколько контейнеров (скопируйте app.yml, а не весь Discourse) с обратным прокси перед ними.
Вы не можете использовать discourse-setup. Он предназначен только для очень простых установок.