Se hai spazio su disco, vale sicuramente la pena aggiungere, diciamo, 2G di swap.
L’altra cosa da fare è monitorare l’utilizzo mentre il tuo grosso lavoro è in esecuzione. Userei vmstat 5 5 e forse registrerei su un file. Speri di non vedere valori elevati nelle colonne si o so, e di non vedere la colonna swpd avvicinarsi alla dimensione del tuo swap.
Forse vedi questo post:
(Sembra possibile che il sistema di database stia esaurendo qualche risorsa, ma non ne so nulla.)