La configuración del sitio reply_by_email_enabled y reply_by_email_address no aparecen en Administrador - Configuración de correo electrónico. Curiosamente, la configuración alternative_reply_by_email_addresses sí aparece.
Parece que les falta una clave area en site_settings.yml, aunque no entiendo cómo aparecen en Administrador - Todas las configuraciones del sitio - Correo electrónico.