No, stiamo eseguendo il nostro ambiente e ho trovato il colpevole.
Eravamo in esecuzione di più attività rake nello stesso comando (RAILS_ENV=production bundle exec rake db:seed_fu multisite:migrate multisite:seed_fu).
Il db:seed_fu era lì per aggirare un bug vecchio di 10 anni. Quando lo eseguo separatamente, il problema scompare. E grazie al tuo commento sopra, ora capisco cosa stava succedendo.