Solo un informe para futuros observadores de que la tarea rake que se ejecutó en OP estaba utilizando
bundle exec rake doc_categories:build_sidebar
y se encontró con el error
ActiveRecord::NoDatabaseError: No pudimos encontrar tu base de datos: discourse. Las configuraciones de base de datos disponibles se pueden encontrar en config/database.yml. (ActiveRecord::NoDatabaseError)
Dependiendo de las configuraciones autoalojadas, es probable que la tarea deba ejecutarse con el usuario discourse para acceder a la base de datos.
sudo -E -u discourse bundle exec rake doc_categories:build_sidebar
@MachineScholar ha confirmado que las secciones y los enlaces se han creado con éxito. 