Похоже, что у site-logo по умолчанию нет атрибутов ширины/высоты, но ширина появляется, когда вы начинаете прокручивать страницу вниз. Это лишь небольшая проблема, но она вызывает жалобы Lighthouse на смещение макета.
Логотип моего сайта имеет высоту по умолчанию 2.667em. Какую тему вы используете?
По умолчанию, и дело не в CSS-высоте, а в отсутствующем атрибуте img.