Почему бы не сохранить центральный сайт с пользователями, но без контента, подключив его к двум подчинённым сайтам через Discourse Connect (SSO)?
Я бы, вероятно, сохранил центральный сайт со всеми пользователями, создал две дополнительные полные копии — x и y, удалил из обеих контент, который не нужен, чтобы разделить их, и настроил их на использование основного сайта для входа.
Это также устранит путаницу при входе для пользователей, которые могут быть в обоих списках.