No creo que cause un salto en móviles, ya que usamos posición fija al hacer scroll y posición absoluta cuando se ancla, por lo que en ningún caso influye en la maquetación.
Hice una prueba rápida donde simplemente lo oculto con CSS cuando recibe la clase docked (porque es por eso que la posición salta al cargar; la página es corta y la barra de progreso se ancla)… no hay salto cuando desaparece/vuelve a aparecer.
La otra opción sería desanclarlo y mantenerlo en posición fija mientras carga, pero el problema es que si saltas hacia la parte superior de la página desde el fondo (como cuando estás en temas sugeridos)… creo que verías un salto de posición cuando la línea de tiempo pasa de estar anclada a una posición fija.
De todas formas, lo probaré y veré qué funciona mejor.