Решение, по-видимому, заключается в ручной пересборке образа через CLI с помощью команды ./launcher rebuild app.
Непонятно, почему при обновлении docker_manager через веб-консоль администратора (с версии 3.3.0 beta1 до 3.3.0 beta2-dev) возникает ошибка MaxMind, тогда как через CLI всё работает. Возможно, при обновлении docker_manager через веб-консоль следует добавить проверку, чтобы не обновлять MaxMind до тех пор, пока не будут обновлены зависимости?