これで動作するようになりました！
Search および Read ツールを有効にした後、その中の「Show Tool Details」をクリックすると、Search Private および Read Private を有効にできます。
これにより、RAG 上のドキュメントを継続的に更新する必要なく、AI アシスタントが準備中のナレッジデータベースを直接読み取ることができるようになります。この情報は、標準ユーザーには非表示になります。 
このパズルの最後のピースは、こちらの投稿で見つかりました: Can I allow the bot on private categories