Ты уже читал это? У меня тоже были трудности с настройкой S3 и Cloudflare, но в конце концов я разобрался. Ты всё ещё можешь использовать Cloudflare для повышения безопасности, но, я почти уверен, что тебе также понадобится отдельный CDN-сервис. Cloudflare работает не как обычный CDN, у него своя специфика. Тебе стоит перейти на более дешёвый сервис S3, Amazon слишком дорогой.